Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Epha1Q60750 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha1Q60750 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms