Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nr2f1Q60632 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nr2f1Q60632 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms