Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sema5bQ60519 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sema5bQ60519 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms