Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tdrd5Q5VCS6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tdrd5Q5VCS6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms