Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rabl6Q5U3K5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms