Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r196Q5SVD5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r196Q5SVD5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms