Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd40Q5SUE8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd40Q5SUE8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms