Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tns3Q5SSZ5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tns3Q5SSZ5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms