Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vmn1r223Q5SSA0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms