Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trdv4Q5R1A3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trdv4Q5R1A3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trdv4Q5R1A3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trdv4Q5R1A3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trdv4Q5R1A3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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