Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtp3Q5QGU6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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