Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc1Q5NCF2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms