Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim58Q5NCC9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim58Q5NCC9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms