Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spata48Q5NC83 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms