Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnni3kQ5GIG6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms