Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtl5Q5DTT4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms