Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBD2

Tapt1, Transmembrane anterior posterior transformation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tapt1Q4VBD2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tapt1Q4VBD2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tapt1Q4VBD2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms