Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Snhg11Q4G0K9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms