Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brinp3Q499E0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brinp3Q499E0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms