Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx25Q3ZT31 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx25Q3ZT31 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms