Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc110Q3V125 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms