Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc185Q3V118 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc185Q3V118 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms