Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp48Q3V0C5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
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Usp48Q3V0C5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp48Q3V0C5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp48Q3V0C5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp48Q3V0C5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Usp48Q3V0C5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp48Q3V0C5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp48Q3V0C5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Usp48Q3V0C5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Usp48Q3V0C5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Usp48Q3V0C5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Usp48Q3V0C5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Usp48Q3V0C5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Usp48Q3V0C5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp48Q3V0C5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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