Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbm44Q3V089 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbm44Q3V089 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbm44Q3V089 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbm44Q3V089 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbm44Q3V089 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbm44Q3V089 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbm44Q3V089 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbm44Q3V089 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbm44Q3V089 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbm44Q3V089 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbm44Q3V089 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbm44Q3V089 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbm44Q3V089 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbm44Q3V089 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbm44Q3V089 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbm44Q3V089 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbm44Q3V089 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbm44Q3V089 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms