Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc9Q3V038 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc9Q3V038 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc9Q3V038 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc9Q3V038 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc9Q3V038 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc9Q3V038 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc9Q3V038 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc9Q3V038 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttc9Q3V038 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttc9Q3V038 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms