Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed1Q3V009 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms