Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3UZV7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UZV7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UZV7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms