Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nr1d1Q3UV55 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms