Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb2Q3UUV9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms