Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Znf48Q3US17 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Znf48Q3US17 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Znf48Q3US17 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Znf48Q3US17 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Znf48Q3US17 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Znf48Q3US17 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Znf48Q3US17 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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