Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rtl4Q3URY0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rtl4Q3URY0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rtl4Q3URY0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl4Q3URY0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms