Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms