Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lsg1Q3UM18 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lsg1Q3UM18 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms