Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc33Q3ULW6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc33Q3ULW6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms