Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc61Q3UJV1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc61Q3UJV1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms