Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edc4Q3UJB9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edc4Q3UJB9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edc4Q3UJB9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edc4Q3UJB9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edc4Q3UJB9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Edc4Q3UJB9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edc4Q3UJB9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edc4Q3UJB9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edc4Q3UJB9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edc4Q3UJB9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edc4Q3UJB9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edc4Q3UJB9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edc4Q3UJB9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Edc4Q3UJB9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Edc4Q3UJB9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms