Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sf3b2Q3UJB0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sf3b2Q3UJB0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms