Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc34Q3UI66 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms