Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Nkx6-3Q3UHX8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Nkx6-3Q3UHX8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkx6-3Q3UHX8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Nkx6-3Q3UHX8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Nkx6-3Q3UHX8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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