Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf44Q3UHJ8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf44Q3UHJ8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms