Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitpnm3Q3UHE1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitpnm3Q3UHE1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitpnm3Q3UHE1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pitpnm3Q3UHE1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pitpnm3Q3UHE1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pitpnm3Q3UHE1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pitpnm3Q3UHE1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pitpnm3Q3UHE1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pitpnm3Q3UHE1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pitpnm3Q3UHE1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms