Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc177Q3UHB8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc177Q3UHB8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms