Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Yipf3Q3UDR8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms