Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trip13Q3UA06 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms