Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pag1Q3U1F9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms