Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Palb2Q3U0P1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Palb2Q3U0P1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms