Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc9Q3U0M1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc9Q3U0M1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms