Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccndbp1Q3TVC7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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