Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc136Q3TVA9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc136Q3TVA9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms