Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTL0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTL0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms